primer5正式版是一款由Premier公司推出的引物设计软件。primer5官方版内置了酶切分析窗口、纹基分析窗口、引物设计窗口、序列编辑窗口,给专业人员带来了极大的便利。通过primer5软件用户可以进行PCR、测序引物、杂交探针的设计操作,功能更加强大。
软件功能
1、种间交叉引物设计
利用来自多个物种的序列设计扩增引物
2、病理检测引物设计
可以用在高保区域设计引物
3、等位基因特效引物
设计专用于扩增某一类相关序列中特定成员的引物
4、软件的主要功能分四种
即引物设计、限制性内切酶位点分析、dna 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。此外,该软件还有一些特殊功能,其中最重要的是设计简并引物,另外还有序列朗读、dna 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。
5、还可以针对模板dna 的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列。
软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择,有纤毛虫大核(ciliate macronuclear)、无脊椎动物线粒体(invertebrate mitochondrion)、支原体(mycoplasma)、植物线粒体(plant mitochondrion)、原生动物线粒体(protozoan mitochondrion)、一般标准(standard)、脊椎动物线粒体(vertebrate mito-chondrion)和酵母线粒体(yeast mitochondrion)。
软件特色
1、给专业人员带来的极大的便利,另外小编为大家带来的这款最新版本功能更加强大,立足点也是按照引物设计的基本原则,只是更加快速和自动化而已
2、是款用软件设计引物软件,该软件分为四大块,尤其常用的是引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA 基元(motif)查找
3、我们可以直接提交模板序列到特定网页,如著名的primer3,得到设计好的引物,也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件
4、主要界面是分为GeneTank(序列编辑)、Primer(引物设计)、Aling(序列比较)、Enzyme(酶切分析)和Mitif(基序分析)。
5、该软件就是用来进行引物设计的
6、可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物
7、在手动的任何时候,下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等,也可以给定条件,让软件自动搜索引物,并将引物分析结果显示出来
8、使用Primer Premier,操作非常简单
使用教程
1、进入软件之后,主界面如下图所示;
2、点击下雨红框里面的Primer出现下图界面;
3、点击下图红框里面的Search出现下图界面,设置好了之后,点击OK;
4、点击Align出现下图界面,可以进行快速的转换,点击OK即可转换。