Bioxm最新版是一款主业的分析基因序列的工具。Bioxm官方版批量格式转换,您可以使用转换工具将自己分析的化学数据全部转换出来,支持.sepFASTA等格式转换。Bioxm最新版提供实验方法、基因结构分析、蛋白质结构分析、酶切分析、启动子预测、转录因子结合位点预测,增添了影响因子查询功能, 应该比较适用,比上网查找快多了。
基本简介
Bioxm最新版不仅能大大提高DNA的常规分析效率,还采用专业的分析技术帮助您完成后期的数据模拟分析,让您在电脑上就可以得到实验后期的详细数据。Bioxm中还收录了很多常用的基因或蛋白分析网址,包括了多序列比较和进化树分析
功能介绍
酶切位点分析
Bioxm最新版输入序列之后, 依次打开 序列分析>酶切位点分析 , 最后 点"开始分析".
DNA 统计分析
除了分析A,G,C,T,N的组成之外,可以分析GC%的变化趋势.
序列比较
BioXM提供了两个序列比较的BLAST本地工具:
依次打开 序列分析>两个序列BLAST联配:
依次选择序列比较的类型,输入序列后开始比较.
软件特色
序列格式化
Bioxm最新版打开序列分析>序列格式化 , 或者按快捷键F11,
格式化后的序列可以直接用于发表文章.
影响因子查询
打开 工具>2003SCI影响因子查询, 输入刊物名称缩写,如 Plant Mol Biol, Chin Sci, Cell Res......
格式序列转换
打开 工具>序列格式的批量转换>
选择来源文件类型和输出文件类型后,
点"打开文件", 用Ctrl组合键选择多个序列文件,最后点"新文件保存为"保存文件.
使用方法
1、Bioxm最新版点击新建,可以创建一个新的分析方案,你也可以将已经分析完成的项目打印输出
2、编辑:这里可以选择分析界面需要执行的项目数据,可以全部选择、可以进行序列统计、可以更改序列窗口标签
3、系列分析,输出序列分析报告、序列格式化、酶切位点分析、蛋白质分子量和电点计算、DNA序列统计、OPF分析
4、引物分析,您可以在这里复制需要分析的序列,点击下方的计算就可以了
5、批量格式转换,您可以使用转换工具将自己分析的化学数据全部转换出来,支持.sepFASTA等格式转换
6、国内生物学相关影响因子查询,在这里选择查询的年份,输入刊物的名称即可
7、查询影响因子:大多数是缩写 如 Mol, Cell, Plant, biol, Chin, J, 等等
8、收藏夹设置,这里提供实验方法、基因结构分析、蛋白质结构分析、酶切分析、启动子预测、转录因子结合位点预测
常见问题
问:Bioxm最新版输入DNA序列BioXM似乎不能正确识别?
答:这是因为BioXM默认打开的是氨基酸序列,您可以在菜单中选择“序列整理”命令。
问:BioXM序列窗口中的序列容易混淆,怎么办?
答:鼠标双击序列窗口可以更改序列标签名,使您不会混淆各窗口。
问:在BioXM中每次输入DNA序列总是保留其他非法序列怎么办?
答:您可以在选项中打开强制识别序列为DNA,这样就会祛除其他非法序列。但是如果您要打开氨基酸序列,必须关闭此项目。
更新日志
1.Bioxm最新版 增添了影响因子查询功能, 应该比较适用,比上网查找快多了吧.
2. 提供了选项设置卡, 用户可以自由进行设置序列是否自动格式化, 可减少格式化时间.
3. 在菜单中加入了几个图标, 以美化窗体, 但效果不是很理想,没有找到合适的图片.
4. 修正了在98/2000系统下酶切位点显示重叠的错误.